68 篇论文
该研究开发了一种结合原位双碱基编辑与纳米抗体驱动生物传感器的筛选策略（BINDER），在毕赤酵母中成功鉴定出两个关键单核苷酸变异，将重组人血清白蛋白的分泌滴度提升至 23.43 g/L 的工业级水平。
本文介绍了一种名为 CLUSTER 的新型生物正交共价蛋白标记技术，该技术利用 SNAP 标签与内含肽介导的蛋白剪接反应，在活细胞中实现了对目标蛋白高效、低干扰的 5 kDa 小肽荧光标记，并通过细菌筛选、荧光偏振定量表征及分子动力学模拟深入解析了其反应机制与稳定性。
该研究通过首个多中心预临床验证，证实了协调一致的方法学能够成功验证 CCR8 过表达增强 CAR-T 细胞实体瘤浸润能力的策略，并证明了此类多中心确证研究在细胞治疗领域向临床转化中的可行性。
本文提出了一种结合布劳威尔不动点定理与区间可达性分析的几何方法，为证明并严格定位一类基准生物分子振荡器中极限环的存在性提供了简洁而严谨的解决方案。
该研究通过建立高通量 CRISPRi 筛选平台，系统鉴定了大肠杆菌中 31 个调控番茄红素产量的关键基因，揭示了涉及氨基酸、脂肪酸、中心碳代谢及应激反应等多条途径的遗传调控靶点，为优化异戊二烯类化合物产量提供了通用策略。
该研究通过结合 split-GFP 报告系统与 Clp 蛋白酶抑制技术，首次定量揭示了异源酶在聚球藻 PCC 6803 中普遍存在严重降解现象，并证明替换为同源酶比优化遗传元件更能有效解决表达问题，从而为提升光合细胞工厂的产物产量提供了关键指导。
本文提出了一种名为 AncestorGFN 的基于生成流网络（GFlowNets）的无比对方法，通过联合生成序列与探索进化轨迹，在无需多重序列比对的情况下实现了系统发育推断与序列设计。
本文介绍了一种名为 SIRIUS 的整数线性规划算法，旨在通过优化宿主特异性密码子使用偏好，生成共享子序列最少且高度分歧的同义基因序列，从而解决合成生物学中基因设计稳定性不足的问题。
该研究通过系统量化酿酒酵母 98 个基因间区的表达输出并构建预测模型 YeIP，揭示了染色体位置对基因表达的调控作用，进而仅通过理性选择基因组整合位点而非修改启动子或基因拷贝数，成功优化了番茄红素代谢途径的转录化学计量比，为酵母代谢通路的可预测设计提供了数据驱动框架。
本文提出了一种结合自然语言处理与大语言模型的自动化工作流，通过从 PubMed 文献中提取生物分子相互作用构建了首个 CAR-T 细胞信号传导知识图谱，为下一代嵌合抗原受体设计提供了结构化的知识基础。
该研究提出了名为 InfinMark 的端到端 DNA 隐形防伪框架，通过结合物联网与 DNA 物联网技术，利用信息 DNA 纳米粒子实现了从信息转码、纳米封装到多级快速认证的全链条双模防伪系统。
该研究引入可编程 DNA 质子核作为核模拟区室，揭示了拥挤且多价的环境会根本性地重塑 FUS 蛋白的相分离行为，并证明通过调节 DNA 交联可抑制其病理性液 - 固转变，从而弥补了传统体外实验与复杂细胞环境之间的差距。
该论文提出了一种多尺度模型引导的增益调度反馈控制框架，通过根据细菌生长阶段动态调整控制器参数，有效解决了分批培养中因细胞生理状态变化导致的固定增益控制器抗扰性能受限问题。
该研究通过在裂殖酵母中内源性人源化 Rpb9 基因，证实了人类 POLR2I 蛋白在酵母生长、衰老、应激反应及异染色质组装等广泛功能上的保守性，同时揭示了其在化疗药物抗性方面的物种特异性差异。
该研究提出了一种名为 SurPhACE 的合成生物学平台，通过在大肠杆菌表面展示与ΦX174 噬菌体连续进化相结合，实现了无需构建大型文库即可在极短时间内高效筛选和优化纳米抗体等蛋白结合剂。
本研究通过优化 VVD 结构域和连接肽，开发了具有更宽动态范围和更快激活动力学的 LightR 变体，实现了对 Src 激酶活性的增强型光控调节，既能模拟持续激活状态，又能精确模拟细胞内瞬态信号事件。
该研究利用定量 PCR 技术在单切口水平上实现了对 DNA 折纸纳米结构中并行连接反应的全球定量分析，揭示了连接效率受酶对接概率影响而呈现边缘优于内部的分布规律，并发现 DMSO 共溶剂可消除这种差异，为 DNA 纳米结构从实验室走向实际应用提供了关键分析工具。
该研究开发了名为 CRIS-MACE 的哺乳动物细胞连续定向进化平台，通过整合腺病毒递送系统与抗 CRISPR 蛋白的可调选择压力，成功在人类细胞内直接进化出具有增强 DNA 结合能力及对强效抑制剂 AcrIIA4 产生近 1000 倍耐药性的新型 Cas9 变体。
该研究提出了一种名为 MATCH 的模块化生化方法，通过将 SpyTag 肽段整合至 AAV 衣壳并共价偶联特异性结合蛋白，实现了对腺相关病毒（AAV）趋向性的可编程、受体导向的精准重定向，从而显著提升了其在 T 细胞及血脑屏障穿透等特定组织中的转导效率。
该研究通过构建微分方程模型对 synNotch-CAR T 细胞进行数学建模与全局敏感性分析，揭示了配体结合、自激活及下游启动子强度等关键参数，为优化癌症免疫疗法的动态可调性提供了工程化靶点。